拟订全州重大疾病和重点疾病防治规划、免疫规划和严重危害人民健康的公共卫生问题的干预措施并组织实施，完善重大疾病防控体系，防止和控制疾病发生和疫情蔓延；承担法定报告传染病疫情信息工作；负责地方病防治管理工作；负责农村卫生改水改厕工作，拟订规划、标准，指导实施并进行监督检查及评价；承办大理州地方病防治领导小组办公室、大理州计划免疫协调领导小组办公室、大理州鼠害联防领导小组办公室、大理州爱国卫生运动委员会办公室的具体工作；完成委领导交办的其他工作。